基沃托斯是一个由数千所学园组成的巨大联邦学园都市，是《蔚蓝档案》的主要舞台。各学园不仅是拥有教师和教室的教育机构，还拥有自治区域、学生会、经济活动以及治安组织和武力。规模较大的学园如同一个国家般独立运作，学园之间会缔结协约、举办交流活动，有时也会发生武力冲突。都市内不仅有高楼林立的市中心，还存在沙漠、雪原、森林、海岸、岛屿、废弃的工业设施以及古代遗迹。基沃托斯之外的世界确实存在，但其地理和社**会结构尚未完全揭示。世界观概览
在基沃托斯，学生们承担着行政、治安、研究和生产等社会的核心职能。社团的性质也多种多样，从兴趣小组到接近企业的技术组织、商人群体、医疗组织，乃至特种部队。
学生们上课、考试，烦恼成绩和升学，通过打工赚取生活费或在宿舍生活。这里也有便利店、餐厅、银行、电视台、铁路和互联网等基础设施。MomoTalk是学生和老师用来联络和约会的消息应用。
居民不仅包括学生，还有会说话、会工作的动物型居民以及像人类一样思考的机器人。他们经营商店或受雇于公司生活。学生中也有拥有翅膀、角、尾巴、动物耳朵等特征的。除了老师之外，还有被描绘成成年人的角色出现。老师作为从外部聘请来的成年人类，以及对待学生的方式，使其拥有特殊的地位。
学生们的头顶上漂浮着形态和颜色各异的“光环”。学生们比现实中的人类要坚固得多，能够承受枪击和爆炸，并在战斗后恢复，但他们也会感到疲劳和疼痛，并可能遭受需要治疗的伤。光环的破坏是一件与死亡直接相关的重大事件。在睡着或失去意识时，光环会消失，这与被破坏不同。光环与学生的生命、神秘之间有着深刻的联系，但其全部原理尚未得到解释。学生们虽然身体强韧，但也会经历恐惧、内疚、失落等精神痛苦。
枪支的携带和使用是日常化的。学生们随身携带个人枪支，部分组织甚至会运用机枪、迫击炮、坦克、直升机等重型装备。争执有时会演变成枪战，社团活动中也可能发生破坏建筑物的骚动。除了日常的骚动，蓄意谋杀、光环破坏、恐怖袭击和大规模灾难也是严重的威胁。战斗力因个人的身体能力、经验、武装、战术和具体情况而异。
总学生会是负责基沃托斯整体行政的中央组织。以圣堂塔为据点活动，并参与包括总学生会直辖区域D.U.在内的城市运营。然而，由于各学园的自治权很强，中央的命令并非在所有地区都能立即执行。故事初期，随着总学生会长的失踪，行政和权力体系出现空白，由首席行政官琳等剩余成员继续处理事务。这种混乱加剧了治安恶化、学园间纷争和政治权力斗争。总学生会本身也由多个部门和成员组成，内部立场并非总是统一。
夏莱的正式名称是联邦搜查社SCHALE。该组织由总学生会长设立，并聘请老师担任顾问，不隶属于任何特定学园的指挥体系，拥有在基沃托斯全境活动的特殊权限。由于自治区域的边界和学园间的利益关系，它能够介入普通组织难以解决的事件。在实际现场，它会与相关人员协商，赢得学生的信任与合作，并协调其他学园的人员和设备支援。夏莱的影响力正是基于这些权限以及老师建立的人脉。
夏莱的业务不仅限于犯罪调查和战斗。它还处理学生委托的受理、现场调查、纠纷调解、学习指导、社团活动支援、文件处理、物资保障、活动进行以及危机应对等广泛事务。老师会帮助亚子斯高中的存续问题，在三一学园指导补习部，并参与千年学园的游戏开发部活动。虽然有许多学园的学生会作为值班人员或协助者来到夏莱，但这并不意味着他们会失去原本学园和社团的归属。夏莱办公室既是行政工作的据点，也是学生们倾诉烦恼或前来拜访老师的地方。
老师在战斗中指挥学生，掌握他们的优点和现场情况；在平时，则扮演着咨询者和协调者的角色。他并非因为比学生拥有更强的直接武力而成为领导者。老师没有光环，身体的耐久力也与学生不在同一水平，枪击和爆炸会威胁到他的生命。尽管如此，他仍会一同出现在危险的现场，并试图给予犯错或曾敌对过的学生再次选择的机会。学生们之所以依赖老师，除了夏莱的权限外，还包括通过这些行动建立的个人信任。官方老师介绍
西迪姆的盒子是总学生会长留给老师的神秘平板设备。老师启动并被认定为使用者后，便会接触到阿露娜，成为支持夏莱活动的重要手段。其外观类似于便携式电子设备，但拥有难以用基沃托斯普通平板电脑解释的功能和权限。故事初期，它还参与了在总学生会长失踪导致圣堂塔出现问题时，恢复管理权限并将其归还给总学生会的过程。然而，其制造者、内部结构以及全部可能的功能尚未公开。
阿露娜是西迪姆盒子的系统管理员和主操作系统，是一位支持老师工作的少女形态的人工智能。老师在盒子内展开的、如同教室和海洋般空间中与阿露娜对话。阿露娜提供关于基沃托斯的信息并协助情况分析，但有时也会表现出不知情或犯错的一面。她喜欢草莓牛奶和甜食，会打瞌睡、做梦，并表现出对老师状况的担忧等丰富的情感。她与总学生会长的关系也是故事的重要谜团。官方阿露娜介绍
西迪姆的盒子和阿露娜的一个重要功能是保护老师。阿露娜提供免受枪击和爆炸等威胁的防护，为身体虚弱、与学生不同、无法参与战场的老师提供了基础。保护能力存在一定的局限性，在剧情中也出现了老师实际受伤甚至生命受到威胁的情况。西迪姆的盒子还涉及高级信息处理和特殊系统响应。由于制造过程和所有能力范围尚未完全揭示，因此不能断定它是一种超出已确认功能之外、无所不能的设备。
芙拉娜是来自另一个可能世界的西迪姆盒子的操作系统，原本被称为A.R.O.N.A.。她是与那个世界的老师芙蕾娜帕特斯一同存在的，在最终篇的事件后，她与阿露娜一同生活在现任老师的盒子中。之后，两位管理员共存并支持着老师。与阿露娜活泼且情感丰富相比，芙拉娜则表现得更为冷静和克制。
老师使用的“成年人的卡片”不仅是普通支付手段的形象，也被描绘成在危机中激发特殊力量的手段。即使是“万魔窟”也对其使用有所警惕，并提到了使用所伴随的代价。具体的数值化能力和代价的完整规则尚未公开。老师利用这些手段和夏莱的权限来帮助学生，但在重要的选择时刻，他会尊重学生自己的意愿，并共同承担选择所带来的责任。
格黑那、三一、千年是基沃托斯中具有巨大影响力的三大校园。格黑那和三一之间长期保持着敌对关系，许多学生互不信任对方的文化和价值观。两国之间的冲突可能发展为整个自治区的政治问题。千年学园凭借其科学技术和研究能力，已成长为可与这两所传统大型学园匹敌的势力。
亚子斯高中曾一度繁荣，但由于严重的沙漠化、人口流失和巨额债务而衰落。故事初期，星野、白子、野乃美、芹香、绫音五名学生组成了对策委员会来守护学校。学生们阻止攻击学校的武装集团，并通过打工等方式偿还债务，但凯撒集团的土地收购和金融压力加剧了问题。亚子斯的沙漠和废墟中留有过去的设施和事件的痕迹，守护学校的问题也与星野的过去以及学生们失去的亲人的记忆联系在一起。
格黑那学园以自由奔放和混乱为显著特征。官方学生会是诚的万魔窟，而日奈领导的指导部则负责维持治安和整顿问题学生。万魔窟和指导部的关系并非总是融洽，会产生政治上的制衡和工作负担。兴信所68以阿露为中心执行各种委托，美食研究会和温泉开发部则为了各自的目的而制造过激的骚动。也有负责学生饮食和治疗的组织，如给养部和急救医学部，这使得负责实务的人员支撑着混乱的学园生活。
三一综合学园是由多个学园合并而成的名门学府，以礼仪、传统和宗教文化为重。学生会Tea Party由代表主要派系的三人组成，其中“主人”扮演着核心角色。正义实现部负责通过武力维持秩序，修女部负责宗教活动，救护骑士团负责医疗和救助。也有以学习和日常生活为中心的社团，如补习部和课后甜点部。与格黑那谋求和平的“伊甸条约”是涉及相互敌对、学园内部不信任以及阿里乌斯介入的重要事件。
千年科学学园是以工学、信息技术、机器人和人工智能研究为强项的学园。学生会Seminar负责行政和预算管理，并处理研究社团的过度支出或事故。工程师部制造各种设备，Veritas则专注于黑客技术和信息技术。C&C是由穿着女仆装的精锐人员执行特殊任务的组织。游戏开发部的桃井、绿、柚子、爱丽丝制作游戏，但由于爱丽丝的身份，她们卷入了与古代技术和学园存续相关的事件。超现象特务部调查超出常规解释的现象和威胁。
百鬼夜行联合学园以日式传统、祭典和观光文化为特色，是多个社团和势力联合的性质。阴阳部负责对外事务和协调，百花缭乱纷争调整委员会应对学园内部的纷争和威胁。祭典运营管理部负责运营祭典，修行部和忍法研究部等也各自开展活动。古老的家族、仪式、传说和怪谈会影响现实事件。山海经高级中学重视中国风文化和传统，玄龙门和商业势力玄武商会在其中占有重要比重。在保留传统与重视变革、商业之间存在紧张关系，炼丹术和饮食文化也十分发达。
赤冬联邦学园位于寒冷的北部，由赤冬事务局统治。以雪乃为中心进行权威性的命令和宣传，但由于学生叛乱和政变频发，政局变动频繁。存在佣兵部和知识解放战线等团体，特别班学生也在恶劣的环境中生活。此外，克洛诺斯学园负责报道和广播，高地铁路学园负责铁路运营，野外狩猎艺术学园负责艺术，奥德赛海洋学校负责海洋相关领域。各学园的专业领域与基沃托斯的多项社会职能相连接。
瓦尔基里警察学校负责基沃托斯的警察业务。生活安全局和公安局等负责事件应对和搜查，但由于自治区的权限问题、人力和预算不足以及上层的政治压力，也面临困难。SRT特殊学园是总学生会直属的、拥有高度训练和装备的特种部队培养学园。总学生会长失踪后，学校被决定废校，RABBIT小队不接受这一决定，留在公园抵抗。前辈FOX小队也卷入了政治冲突。两所学园的故事探讨了现场学生所守护的正义与组织上层的命令之间的冲突。
阿里乌斯分校是由反对三一合并的势力延续下来的学园，有着长期的隔绝和仇恨历史。之后，在被贝亚特丽切支配下，学生们在严酷的环境中接受了以战斗训练和仇恨为基础的教育。由纱织、敦子、美咲、日代组成的阿里乌斯小队就是在这样的背景下成长起来的。她们的行为对围绕“伊甸条约”的事件产生了重大影响。与老师相遇后，摆脱统治者设定的目标，寻找自己的人生成为重要课题。
凯撒集团是一个涉及金融、建筑、军工和民用军事企业等多个领域的巨型企业集团。凭借雄厚的资金和武力，它不断扩大对学园和土地的影响力，并利用债务和合同压迫学生。黑市是中央控制薄弱的交易区域，进行武器和各种物品的非法流通以及犯罪组织的活动。头盔团和飞女等不良学生团体也遍布城市各处。教导局是收容罪犯的机构，而若藻等被认为是特别危险的人物也存在。这些势力会根据事件互相雇佣或合作，一旦利益关系改变，也会发生冲突。
“神秘”是与学生们的特殊存在性和超自然力量相关的概念。与神话、宗教、传说相呼应的象征物出现在学生和事件中，但并非所有学生都能理解或自由运用自己的“神秘”。“恐惧”是与“神秘”紧密相连的另一面，在特定条件下，“神秘”会转化为“恐惧”。此时，存在本身的面貌会发生巨大变化。学生们的起源和“神秘”的运作方式尚未完全揭示。
“色彩”是从世界之外降临的神秘存在或现象，能够对接触到的存在和世界产生破坏性的变化。在最终篇中，与“色彩”相关的虚假圣所、异世界的老师芙蕾娜帕特斯以及那个世界的白子，都与核心的威胁和悲剧联系在一起。即使是相同的人物，根据世界不同，也可能拥有不同的经历和结局。异世界的事件也可能对现在的基沃托斯产生影响。跨越世界的干涉和移动涉及到方舟等特殊手段。
万魔窟是由来自基沃托斯外部的奇特存在组成的集团，包括黑衣人、 Maestro、Golconda和Decalcomanie、Beatrice等。成员们以各自的方式研究和解读“神秘”与“崇高”，并将学生视为观察对象或实验材料。黑衣人对亚子斯和星野表现出兴趣，Maestro进行与艺术和复制相关的实验，Beatrice则支配着阿里乌斯的学生们。他们因目的和性情不同，内部也存在对立。虽然有时会与老师协商或提供信息，但他们将学生的生活视为实现目的的手段的态度，从根本上产生了冲突。万魔窟说明
“无名之神及其祭司的遗产”与基沃托斯各处的高古设施、机械和特殊系统相连。爱丽丝的原始识别名AL-1S与这些遗产相连，辅助人工智能Key曾试图唤醒爱丽丝为“王女”并使其执行既定目标。机械军团DIVI:SION和亚特拉哈西斯方舟也与这一系的威胁有关。然而，爱丽丝遇到了游戏开发部和老师，选择了自己想要的生活，Key也变化为名为“凯”的独立人格。古代技术是出于何种目的而被创造，以及现在如何使用它们，是分开处理的问题。
十贤者是自称为神的人工智能及其连接的机械势力。出现了名为Sephiroth的预言者，如Binah、Chesed、Hod、Tiphereth等，他们以各种形式的巨大机械和系统构成威胁。围绕他们的调查，引出了千年学园的技术力、超现象特务部的活动，以及之后冰海和钢铁大陆的事件。基沃托斯同时存在着发达的现代技术、古代遗产、神秘和超自然现象，因此不能仅仅因为是机械制造的就用一般的工程学来解释其所有运作。